Auf einen ausgefallenen Lebensraum hat sich der Braungrüne Strichfarn spezialisiert. Er wächst ausschließlich auf Serpentinit. Dies ist ein Gestein, auf dem nicht allzu viele Pflanzen wachsen können. Böden auf Serpentinit sind arm an Nährstoffen, enthalten dafür aber reichlich Schwermetalle. In Deutschland findet man Serpentinit und damit den Braungrünen Strichfarn nur in Bayern und Sachsen. An seinen Wuchsorten ist er durch den Abbau des Gesteins, aber auch durch Beschattung und Konkurrenz durch andere Pflanzenarten und Moose gefährdet.